Fundusz Spójności współfinansuje projekty w dziedzinie środowiska naturalnego oraz infrastruktury transportu. Fundusz przyczynia się zarówno do realizacji celów europejskiej polityki transportowej, ekologicznej jak i celów polityki spójności, której efektem jest zmniejszanie się dysproporcji ekonomicznych i społecznych między poszczególnymi państwami. Takie rozumienie interwencji wspólnotowej w tym obszarze odzwierciedla też filozofię trwałego i zrównoważonego rozwoju, w szczególności zwiększanie produktywności i konkurencyjności gospodarki głównie poprzez rozwój infrastruktury transportowej, lecz zarazem nie kosztem środowiska i jego zasobów, a przez to - kosztem przyszłych pokoleń.

Projekt „Oczyszczanie ścieków we Włocławku” obejmował 3 zadania:
- „Modernizacja i rozbudowa oczyszczalni ścieków” – zadanie zostało zakończone w sierpniu 2007 r. W wyniku tego zadania włocławska oczyszczalnia została gruntownie zmodernizowana oraz znacznie rozbudowana, m.in. o komory fermentacyjne wraz z instalacją biogazu. Warto podkreślić, że spełniony został główny cel zadania, a mianowicie znacznie zredukowany został ładunek zanieczyszczeń w ściekach odprowadzanych do rzeki Wisły.

- „Rozbudowa sieci kanalizacyjnej z przepompowniami” – dzięki temu zadaniu miasto Włocławek w 4 dzielnicach zyskało ok. 27,8 km nowej oraz 2,8 km wyremontowanej sieci kanalizacyjnej. Ponadto ogółem wybudowano i wyremontowano 5,6 km przyłączy kanalizacyjnych. W ramach tego zadania powstało również 15 przepompowni ścieków i zmodernizowano 1 przepompownię. W celu zapewnienia transferu ścieków z dzielnicy Zawiśle do oczyszczalni położonej na lewym brzegu Wisły wybudowano system zbiorczy kanalizacji ciśnieniowej, który składa się z rurociągu umieszczonego pod dnem rzeki Wisły metodą przewiertu sterowanego. W wyniku przeprowadzonych robót ścieki nieoczyszczone z dzielnicy Stare Miasto, które dotychczas zanieczyszczały rzekę Wisłę, skierowane zostały do miejskiej sieci kanalizacyjnej, do której również będą mogli podłączyć się mieszkańcy dzielnicy Michelin – Mielęcin, korzystający dotychczas z szamb.

- „Obróbka i utylizacja osadów ściekowych” – w ramach tego kontraktu wybudowana została suszarnia, w której osady ściekowe będą suszone do zawartości 90% suchej masy, aby w końcowym etapie utylizacji mogły być współspalane w piecach pobliskiej cementowni.

Obecnie trwa procedura odbioru zakończonych robót, w miesiącu październiku w MPWiK planuje się uroczyste zakończenie Projektu.