W przeprowadzonym 2 stycznia losowaniu I rundy II etapu wzięły udział zwycięskie zespoły z I etapu, czyli Anwil Włocławek, Energa Czarni Słupsk, Polpharma Starogard Gdański, Rosa Radom, a także Stabill Jezioro Tarnobrzeg (w zastępstwie Śląska Wrocław) oraz trzy najlepsze drużyny IMBC na szczeblu PZKosz: Polfarmex Kutno, MOSiR PBS Bank KHS Krosno, Intermarché Bricomarche BM SlamStal Ostrów.

W wyniku losowania powstały następujące pary:
Intermarché Bricomarche BM SlamStal Ostrów – Anwil Włocławek
Energa Czarni Słupsk – Polpharma Starogard Gdański
Polfarmex Kutno – Stabill Jezioro Tarnobrzeg
MOSiR PBS Bank KHS Krosno – Rosa Radom

Spotkania rozegrane zostaną 15 stycznia 2014 r. Rywalizacja w powyższych parach odbywać się będzie w systemie jednomeczowym. Gospodarzami meczów są zespoły wymienione w parach jako pierwsze. Zwycięzcy poszczególnych par uzyskają awans do kolejnej rundy II etapu rozgrywek. Wtedy do rywalizacji dołączą Stelmet Zielona Góra i PGE Turów Zgorzelec.

Gospodarzem Final Four Intermarché Basket Cup (co oznacza automatyczny awans do turnieju finałowego) będzie ostatni ligowy rywal Anwilu, czyli Śląsk Wrocław. Turniej Final Four IMBC (półfinały i finał, bez meczu o trzecie miejsce) rozegrany zostanie w dniach 8-9 lutego 2014 r.