Co roku Urząd Marszałkowski wspiera działalność pozarządówek między innymi w ramach uruchomionych przez zarząd województwa otwartych konkursów ofert na wykonywanie zadań publicznych. Prowadzona jest też kampania zachęcającą do przekazania 1 procenta podatku dochodowego na rzecz wybranej organizacji pożytku publicznego w regionu.

Ciałami opiniodawczymi i konsultacyjnymi wspierającymi współpracę samorządu województwa z organizacjami pozarządowymi są Rada Działalności Pożytku Publicznego, w skład której wchodzi siedmioro przedstawicieli trzeciego sektora, czworo reprezentantów Urzędu Marszałkowskiego, dwoje członków wskazanych przez sejmik województwa i jednego przez wojewodę oraz Sejmik Organizacji Pozarządowych Województwa Kujawsko-Pomorskiego - gremium tworzone przez reprezentantów sektora ngo-sów z całego województwa. Oba zespoły współpracują ściśle z działającym w strukturach Urzędu Marszałkowskiego Biurem Współpracy z Organizacjami Pozarządowymi.  

Każdego roku pozarządówki z regionu otrzymują środki z budżetu województwa na realizację setek różnego rodzaju projektów z zakresu ochrony zdrowia, spraw społecznych, rozwiązywania problemów uzależnień, a także kultury, sportu i turystyki. W ubiegłym roku dotacje rozdysponowane zostały w ramach 25 otwartych konkursów ofert. 

Tegoroczne konkursy są w toku. Środki dla organizacji pozarządowych są też dostępne w ramach wielu konkursów dotyczących realizacji projektów finansowanych ze środków Unii Europejskiej w ramach Regionalnego Programu Operacyjnego. Chodzi między innymi o wsparcie, którym dysponują lokalne grupy działania i w których pozarządówki same aktywnie działają.

Samorząd województwa co roku wyróżnia też najlepsze organizacje pozarządowe w regionie, przyznając nagrody w konkursie „Rodzynki z pozarządówki”. W 2018 roku ten tytuł otrzymało 12 organizacji. Urząd Marszałkowski zachęca też do przekazania 1 procenta podatku dochodowego na rzecz wybranej organizacji pożytku publicznego, publikując listę ngo-sów z  regionu, którym można przekazać takie wsparcie.