W 1997 roku Uczelnia zmieniła nazwę na Wyższą Szkołę Humanistyczno-Ekonomiczną we Włocławku. WSHE jest Uczelnią niepubliczną wpisaną do rejestru Ministra Edukacji Narodowej pod pozycją 69. Założycielem jest Włocławskie Towarzystwo Naukowe.

Piętnaście lat, to długi czas w szkolnictwie wyższym niepublicznym w Polsce. Wyższa Szkoła Humanistyczno-Ekonomiczna we Włocławku jest najstarszą uczelnią tego sektora kształcenia w naszym województwie.

Początki były skromne. Jeden kierunek studiów i zajęcia prowadzone w wynajmowanych pomieszczeniach. Aktualnie Uczelnia posiada uprawnienia do prowadzenia 14 kierunków studiów: administracji, bezpieczeństwa narodowego (nowy kierunek), ekonomii, europeistyki, filologii polskiej, filozofii, historii, informatyki, ochrony środowiska, pedagogiki, pielęgniarstwa, położnictwa, socjologii i wychowania fizycznego. Większość kierunków posiada akredytacje Państwowej Komisji Akredytacyjnej. Natomiast kierunki tj. pielęgniarstwo i położnictwo posiadają akredytację Krajowej Rady Akredytacyjnej Szkolnictwa Medycznego. Uczelnia oferuje także 27 studiów podyplomowych adresowanych zarówno do nauczycieli jak i do samorządowców, menedżerów i finansistów.

Wyższa Szkoła Humanistyczno-Ekonomiczna we Włocławku prowadzi działalność naukową i wydawniczą. Obecna jest również w Europejskim Obszarze Szkolnictwa Wyższego. W ramach LLP Erasmus do tej pory WSHE podpisała kilkanaście umów partnerskich a także dwie umowy bilateralne o drożności kształcenia – z University of Abertay Dundee w Szkocji oraz z uniwersytetem z Zittau w Niemczech. Uczelni realizuje 4 projekty unijne adresowane do mieszkańców województwa, w tym również studia pomostowe bezpłatne dla pielęgniarek.

Uczelnia prowadzi od początku tego roku akademickiego Kujawsko-Dobrzyński Uniwersytet Trzeciego Wieku, w którym aktywnie działa już ponad 150 osób. Przy WSHE rozpoczął pracę Akademicki Inkubator Przedsiębiorczości, jako miejsce dla młodych ludzi pragnących budować swoją ścieżkę kariery w oparciu o własny biznes.

Uczelnia od lat aktywnie działa na rzecz środowiska lokalnego i regionalnego – konkursy tematyczne, Szkoły Letnie dla Dzieci, Debaty Obywatelskie, Wieczory Europejskie to projekty Uczelni, które cieszą się ogromną popularnością wśród mieszkańców Włocławka oraz okolic. Wyższa Szkoła Humanistyczno-Ekonomiczna we Włocławku jako pierwsza uczelnia wyższa z tej części województwa kujawsko-pomorskiego podjęła ścisłą współpracę ze szkołami ponadgimnazjalnymi w ramach tzw. patronatów.

Wyższa Szkoła Humanistyczno-Ekonomiczna we Włoclawku znajduje się w czołówce najlepszych uczelni niepublicznych magisterskich w naszym regionie (wg rankingu uczelni wyższych 2010 „Rzeczpospolitej” i „Perspektyw”).