Przygotowania do uzyskania certyfikatu rozpoczęły się w sierpniu 2013 roku i zakończyły się pod koniec sierpnia tego roku niezależnym audytem. Wdrożenie normy polegało na opracowaniu i zastosowaniu procedur, które uregulowały poszczególne obszary działalności szpitala.

Efektem przyznania certyfikatu ISO 9001 jest podniesienie jakość usług poprzez opracowanie systemu procedur szybkiego rozpoznawania i rozwiązywania problemów przez pracowników placówki, usprawnienie zarządzania placówką, ulepszenie współpracy między lekarzami a pacjentami w procesie leczenia. Jest to pierwszy tej rangi certyfikat, który szpital uzyskał w swojej 50-letniej historii.

Od kilku lat trwa połączona z rozbudową i doposażeniem modernizacja włocławskiego Wojewódzkiego Szpitala Specjalistycznego, finansowana przez samorząd województwa ze środków z kredytu pomocowego Europejskiego Banku Inwestycyjnego oraz Regionalnego Programu Operacyjnego Województwa Kujawsko-Pomorskiego.

W 2010 roku, za łącznie ponad 3 miliony złotych, przeprowadzono kompleksową modernizację budynków dla oddziałów kardiologii i urologii. W tym samym roku na oddziały i do pracowni specjalistycznych trafiły sprzęt i aparatura medyczna za blisko 7 milionów złotych, w tym wysokiej klasy tomograf komputerowy.  W październiku 2013 roku oddano do użytku nowy czterokondygnacyjny pawilon dla oddziałów dziecięcych i oddziału internistycznego, wyposażony w lądowisko dla helikopterów medycznych na dachu. Wartość inwestycji wynosi 18 milionów złotych.

W zeszłym miesiącu odbyło się uroczyste podpisanie umowy na zakup rezonansu magnetycznego. Szpital otrzymał na zakup nowoczesnego sprzętu 7 milionów złotych dofinansowania z naszego RPO.